供奉甲級戰犯 日政府主導
供奉甲級戰犯的靖國神社，一直令中日關係存有陰影。日本政府一直聲稱，將甲級戰犯擺放靖國神社供奉是神社本身決定，神社亦無牴觸憲法中政教分離原則。但日本媒體引述有關一文件顯示，整件事一直由政府主導。
《朝日新聞》調查日本政府厚生勞動省的內部資料，意外發現前政府厚生省文件，顯示一九五三年，厚生省曾決定先將二戰被判死刑的甲級戰犯的靈位，供奉於福岡等地的護國神社，最終以存入東京靖國神社為目標的方針。
據已公開的靖國神社和厚生省會議紀錄，雙方在一九六九年確認符合供奉資格名單，但註明「避免向外公布」。至一九七八年，十四名甲級戰犯，包括前首相東條英機，移到靖國神社正式供奉。
前首相小泉純一郎和安倍晉三都曾參拜靖國神社，而每次參拜，中國和南韓都強烈不滿。